Choroba Leśniowskiego-Crohna i jej różnorodny sposób manifestowania i prezentacji objawów klinicznych powoduje, że diagnostyka i rozpoznanie przysparza wielu trudności. do najczęstszych objawów zgłaszanych przez pacjenta należą:

• przewlekła biegunka ? do kilkunastu stolców na dobę bez domieszki krwi (co różnicuje ja z colitis ulcerosa, gdzie biegunce towarzysza krew, ropa, śluz)
• ból,
• gorączka,
• utrata masy ciała,
• krwawienia z przewodu pokarmowego w efekcie nasilania się głębokości procesu zapalnego.
• wyniszczenie ? cachexia, w badania hipoalbuminemia, niedożywienie, spadek wartości morfologii
• badalny opór w jamie brzusznej ? region prawego talerza biodrowego w przypadku ileitis terminalis.

objawy z pozajelitowe:

• Stwardniające zapalenie dróg żółciowych
• Zapalenie naczyniówki oka ? uveitis, conjuctivitis,
• Zgorzelinowe zapalenie skóry ? pyodermia gangrenosum, erythema nodosum
• Zapalenie stawów - spondyloarthritis zysk
• zaburzenia wzrostu
• opóźnione dojrzewanie, cechy płciowe drugorzędowe
• objawy okołoodbytnicze: przetoka, ropień
• megacolon toxicum

objawy związane z lokalizacja objawów

• typ objawów zależny od postaci: zapalna, z przetokami, z zwężeniami przewodu pokarmowego
• hipoproteinemia, utrata albumin - 24 mg/kg m.c./dzień, co
• stanowi ponad 15 ? krotne zwiększenie wydzielanie białek do światła jelita w stosunku do stanu zdrowia
• upośledzone wchłanianie węglowodanów, białek, tłuszczów, witaminy B12, niedobór witamin A, D, E, K

lokalizacja:

• końcowy odcinek jelita cienkiego ileitis terminalis 40-50% - guz zapalny, ropień, przetoka, zwężenie światła jelita, odczynowe powiększenie węzłów chłonnych ? lymphadenitis mesenterialis, objawy i obraz kliniczny podobne, imitujące objawy zaplenia wyrostka robaczkowego.
• jelito grube wraz z odbytnicą 20% - objawy krwawienia z dolnego odcinka p. pokarmowego ? objawy stanowiące trudności w diagnostyce różnicowej z colitis ulcerosa, decydujące znaczenie maja badanie histopatologiczne oraz badania immunologiczne (p-ANCA, ASCA i inne)
• wspólnie jelito cienkie + jelito grube 30-40%

ponadto w przypadku długiego okresu od rozpoznania choroby, czujność onkologiczna, ryzyko rozwoju raka jelita grubego wzrasta w raz z czasem trwania choroby.